El estudio de los diversos factores que intervienen para causar la enfermedad, como son el medio ambiente, el huésped y las características del agente infeccioso, son importantes para coadyuvar a disminuir los estragos que éstas enfermedades ocasionan mediante la generación de nuevos tratamientos y vacunas que ayuden a su prevención, control y erradicación.

En el Departamento de Enfermedades Infeciosas, se estudia la colisepticemia aviar, enfermedad causada por la bacteria "Escherichia coli" patógena, diferente a la E. coli de flora normal, ya que posee características de virulencia que le permiten a la bacteria sobrevivir en el medio ambiente y evadir los mecanismos de defensa del ave. Se están estudiando los mecanismos que utiliza la bacteria para causar la enfermedad como son las moléculas de superficie bacteriana que le permiten colonizar, así como las posibles estrategias que usa para diseminarse a través de los tejidos.